Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP2O75044 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRGAP2O75044 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SRGAP2O75044 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP2O75044 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP2O75044 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms