Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD1O60671 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD1O60671 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD1O60671 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD1O60671 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD1O60671 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAD1O60671 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD1O60671 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD1O60671 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD1O60671 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD1O60671 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD1O60671 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD1O60671 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD1O60671 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD1O60671 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD1O60671 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD1O60671 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD1O60671 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD1O60671 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD1O60671 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD1O60671 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD1O60671 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD1O60671 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD1O60671 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD1O60671 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAD1O60671 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD1O60671 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD1O60671 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD1O60671 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD1O60671 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD1O60671 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD1O60671 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD1O60671 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD1O60671 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD1O60671 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD1O60671 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD1O60671 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD1O60671 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD1O60671 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD1O60671 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAD1O60671 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD1O60671 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD1O60671 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD1O60671 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD1O60671 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAD1O60671 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAD1O60671 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD1O60671 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD1O60671 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD1O60671 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAD1O60671 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD1O60671 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD1O60671 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD1O60671 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD1O60671 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD1O60671 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD1O60671 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD1O60671 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD1O60671 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD1O60671 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD1O60671 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD1O60671 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD1O60671 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD1O60671 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD1O60671 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD1O60671 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD1O60671 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD1O60671 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD1O60671 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD1O60671 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD1O60671 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD1O60671 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD1O60671 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD1O60671 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD1O60671 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD1O60671 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD1O60671 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD1O60671 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD1O60671 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD1O60671 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD1O60671 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD1O60671 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD1O60671 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD1O60671 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD1O60671 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD1O60671 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD1O60671 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD1O60671 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD1O60671 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD1O60671 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD1O60671 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD1O60671 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD1O60671 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms