Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARPC5O15511 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARPC5O15511 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5O15511 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5O15511 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5O15511 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARPC5O15511 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5O15511 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5O15511 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5O15511 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARPC5O15511 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5O15511 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5O15511 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5O15511 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5O15511 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARPC5O15511 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5O15511 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5O15511 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARPC5O15511 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARPC5O15511 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARPC5O15511 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARPC5O15511 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms