Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GRIN2DO15399 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GRIN2DO15399 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GRIN2DO15399 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GRIN2DO15399 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GRIN2DO15399 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRIN2DO15399 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms