Protein–RNA interactions for Protein: O14562

UBFD1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBFD1O14562 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBFD1O14562 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBFD1O14562 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBFD1O14562 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBFD1O14562 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBFD1O14562 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBFD1O14562 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBFD1O14562 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBFD1O14562 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBFD1O14562 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms