Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms