Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PTPRTO14522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PTPRTO14522 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PTPRTO14522 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRTO14522 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PTPRTO14522 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRTO14522 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRTO14522 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRTO14522 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRTO14522 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
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