Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM238C9JI98 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM238C9JI98 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TMEM238C9JI98 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMEM238C9JI98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms