Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RIIAD1A6NNX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RIIAD1A6NNX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIIAD1A6NNX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIIAD1A6NNX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms