Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIT2A6NDA9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRIT2A6NDA9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRIT2A6NDA9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRIT2A6NDA9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms