Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM30A4D0T7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM30A4D0T7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMIM30A4D0T7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM30A4D0T7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM30A4D0T7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms