Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCDC2BA2VCK2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DCDC2BA2VCK2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DCDC2BA2VCK2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCDC2BA2VCK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCDC2BA2VCK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms