Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVG6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVG6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVG6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVG6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A1B0GVG6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVG6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GVG6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms