Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
A0A087WWV3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
A0A087WWV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
A0A087WWV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
A0A087WWV3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
A0A087WWV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
A0A087WWV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms