Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD20A3Q5VUR7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD20A3Q5VUR7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms