Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOHLH1Q5JUK2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms