Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 ZNF598-207ENST00000565396 4457 ntTSL 221.57■■□□□ 1.042e-6■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ZNF598-203ENST00000562988 3382 ntTSL 520.33■□□□□ 0.842e-6■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.221e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.31e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-217ENST00000555566 734 ntTSL 312.51□□□□□ -0.411e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.521e-13■□□□□ 10
SLTMQ9NWH9 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.673e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.291e-11■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 GMDS-209ENST00000531690 515 ntTSL 56.88□□□□□ -1.315e-6■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 EPB41-210ENST00000482464 675 ntTSL 218.23■□□□□ 0.515e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.565e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 EPB41-207ENST00000373800 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.635e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.715e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.875e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 EPB41-202ENST00000347529 2676 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.95e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SGTA-203ENST00000587866 841 ntTSL 518.51■□□□□ 0.556e-6■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC7.8□□□□□ -1.162e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-208ENST00000454324 2359 ntTSL 25.01□□□□□ -1.612e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-207ENST00000449777 2207 ntTSL 24.85□□□□□ -1.632e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.662e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.772e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.772e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.92e-10■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.574e-12■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SLC22A31-204ENST00000568161 651 ntTSL 315.34■□□□□ 0.054e-12■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 27.29□□□□□ -1.241e-7■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 35.29□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.694e-6■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.574e-6■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 213.53□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 SRRM2-212ENST00000572952 1118 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-21■□□□□ 9.9
SLTMQ9NWH9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.815e-10■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.745e-10■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.55e-10■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 GBGT1-205ENST00000470431 2870 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.095e-10■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 GBGT1-206ENST00000472281 2948 ntTSL 214.7□□□□□ -0.065e-10■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 ACTN4-210ENST00000588618 1729 ntTSL 1 (best)23.5■■□□□ 1.355e-15■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 STAT5B-202ENST00000415845 559 ntTSL 47.61□□□□□ -1.199e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.832e-6■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 NBR2-201ENST00000356906 978 ntTSL 1 (best)8.34□□□□□ -1.072e-6■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 FAM169A-206ENST00000514200 751 ntTSL 418.96■□□□□ 0.639e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.119e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.87■□□□□ 0.934e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.794e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 211.82□□□□□ -0.524e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 59.93□□□□□ -0.824e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 PPP1R12C-203ENST00000586197 472 ntTSL 515.7■□□□□ 0.15e-7■□□□□ 9.8
SLTMQ9NWH9 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 524.56■■□□□ 1.526e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C2orf82-208ENST00000481155 660 ntTSL 322.75■■□□□ 1.236e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CERK-202ENST00000443629 1760 ntTSL 1 (best)22.61■■□□□ 1.215e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 SH3YL1-221ENST00000477707 581 ntTSL 422.03■■□□□ 1.125e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.965e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 220.82■□□□□ 0.925e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C2orf82-206ENST00000467665 2782 ntTSL 1 (best)20.58■□□□□ 0.896e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C17orf62-205ENST00000536759 2222 ntTSL 219.98■□□□□ 0.795e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.696e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.696e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 EPAS1-202ENST00000449347 1067 ntTSL 319.29■□□□□ 0.685e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)19.23■□□□□ 0.675e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.665e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 EPAS1-207ENST00000467888 665 ntTSL 519■□□□□ 0.635e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 518.87■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 LARP1-215ENST00000524248 2128 ntTSL 518.29■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.485e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.445e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.436e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 PIGG-222ENST00000513192 2241 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.435e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.375e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 C17orf62-232ENST00000584024 1965 ntTSL 217.26■□□□□ 0.355e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 PIGG-221ENST00000511666 658 ntTSL 317.19■□□□□ 0.345e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.265e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 SH3YL1-224ENST00000488044 672 ntTSL 416.64■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.235e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 DDX17-209ENST00000479734 441 ntTSL 416.4■□□□□ 0.226e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP3-208ENST00000464263 329 ntTSL 316.02■□□□□ 0.166e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.146e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 EPAS1-203ENST00000460015 558 ntTSL 414.99□□□□□ -0.015e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CNOT3-210ENST00000618939 4516 ntTSL 514.95□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.085e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.086e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 PIGG-214ENST00000508144 1394 ntTSL 1 (best)14.18□□□□□ -0.145e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 PIGG-209ENST00000504879 445 ntTSL 313.93□□□□□ -0.185e-6■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 RAB11FIP3-207ENST00000461009 514 ntTSL 213.74□□□□□ -0.216e-8■□□□□ 9.7
SLTMQ9NWH9 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 9.7
Retrieved 100 of 8,230 protein–RNA pairs in 327.2 ms