RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263734.4

EPAS1-201, Transcript of endothelial PAS domain protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPAS1, Length 5,166 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPAS1-201ENST00000263734 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.28■■□□□ 1.96
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EPAS1-201ENST00000263734 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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EPAS1-201ENST00000263734 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.03■■□□□ 1.28
EPAS1-201ENST00000263734 APLP2Q06481 763 aa22.96■■□□□ 1.27
EPAS1-201ENST00000263734 TRIM41Q8WV44 630 aa22.9■■□□□ 1.26
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EPAS1-201ENST00000263734 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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EPAS1-201ENST00000263734 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.85■■□□□ 1.09
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EPAS1-201ENST00000263734 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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EPAS1-201ENST00000263734 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
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EPAS1-201ENST00000263734 TSPY10P0CW01 314 aa20.63■□□□□ 0.89
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EPAS1-201ENST00000263734 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
EPAS1-201ENST00000263734 OSCARQ8IYS5 282 aa20.36■□□□□ 0.85
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EPAS1-201ENST00000263734 CEP162Q5TB80 1403 aa20.34■□□□□ 0.85
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EPAS1-201ENST00000263734 HMGXB3Q12766 1538 aa20.24■□□□□ 0.83
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