RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584024.5

C17orf62-232, Transcript of Uncharacterized protein C17orf62, humanhuman

TSL 2

Gene C17orf62, Length 1,965 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf62-232ENST00000584024 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.62■■■■□ 3.29
C17orf62-232ENST00000584024 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.83■■■□□ 2.53
C17orf62-232ENST00000584024 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
C17orf62-232ENST00000584024 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.44■■■□□ 2.3
C17orf62-232ENST00000584024 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
C17orf62-232ENST00000584024 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.42■■■□□ 2.3
C17orf62-232ENST00000584024 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
C17orf62-232ENST00000584024 ABCC9O60706 1549 aa28.86■■■□□ 2.21
C17orf62-232ENST00000584024 NACADO15069 1562 aa28.66■■■□□ 2.18
C17orf62-232ENST00000584024 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
C17orf62-232ENST00000584024 SCRIBQ14160 1630 aa28.46■■■□□ 2.15
C17orf62-232ENST00000584024 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.33■■■□□ 2.12
C17orf62-232ENST00000584024 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
C17orf62-232ENST00000584024 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.68■■■□□ 2.02
C17orf62-232ENST00000584024 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.65■■■□□ 2.02
C17orf62-232ENST00000584024 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.54■■■□□ 2
C17orf62-232ENST00000584024 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.5■■□□□ 1.99
C17orf62-232ENST00000584024 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
C17orf62-232ENST00000584024 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.41■■□□□ 1.98
C17orf62-232ENST00000584024 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
C17orf62-232ENST00000584024 WIZO95785 1651 aa27.33■■□□□ 1.97
C17orf62-232ENST00000584024 SMARCA4P51532 1647 aa27.29■■□□□ 1.96
C17orf62-232ENST00000584024 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
C17orf62-232ENST00000584024 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.92■■□□□ 1.9
C17orf62-232ENST00000584024 TRIM41Q8WV44 630 aa26.82■■□□□ 1.88
C17orf62-232ENST00000584024 SMARCA2P51531 1590 aa26.81■■□□□ 1.88
C17orf62-232ENST00000584024 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.81■■□□□ 1.88
C17orf62-232ENST00000584024 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.76■■□□□ 1.87
C17orf62-232ENST00000584024 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
C17orf62-232ENST00000584024 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
C17orf62-232ENST00000584024 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.47■■□□□ 1.83
C17orf62-232ENST00000584024 NCAPD3P42695 1498 aa26.46■■□□□ 1.83
C17orf62-232ENST00000584024 HMGXB3Q12766 1538 aa26.44■■□□□ 1.82
C17orf62-232ENST00000584024 ABCC8Q09428 1581 aa26.38■■□□□ 1.81
C17orf62-232ENST00000584024 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
C17orf62-232ENST00000584024 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
C17orf62-232ENST00000584024 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.09■■□□□ 1.77
C17orf62-232ENST00000584024 EEA1Q15075 1411 aa26.06■■□□□ 1.76
C17orf62-232ENST00000584024 SYNJ1O43426 1573 aa26.02■■□□□ 1.76
C17orf62-232ENST00000584024 CFTRP13569 1480 aa25.99■■□□□ 1.75
C17orf62-232ENST00000584024 SOGA1O94964 1423 aa25.99■■□□□ 1.75
C17orf62-232ENST00000584024 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.96■■□□□ 1.75
C17orf62-232ENST00000584024 TOP2BQ02880 1626 aa25.89■■□□□ 1.74
C17orf62-232ENST00000584024 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.89■■□□□ 1.73
C17orf62-232ENST00000584024 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.84■■□□□ 1.73
C17orf62-232ENST00000584024 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.84■■□□□ 1.73
C17orf62-232ENST00000584024 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.83■■□□□ 1.73
C17orf62-232ENST00000584024 PRDM2Q13029 1718 aa25.81■■□□□ 1.72
C17orf62-232ENST00000584024 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.75■■□□□ 1.71
C17orf62-232ENST00000584024 HRCP23327 699 aa25.73■■□□□ 1.71
C17orf62-232ENST00000584024 CUX1P39880 1505 aa25.72■■□□□ 1.71
C17orf62-232ENST00000584024 GOLGA3Q08378 1498 aa25.71■■□□□ 1.71
C17orf62-232ENST00000584024 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.7■■□□□ 1.71
C17orf62-232ENST00000584024 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.67■■□□□ 1.7
C17orf62-232ENST00000584024 KIF21BO75037 1637 aa25.65■■□□□ 1.7
C17orf62-232ENST00000584024 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
C17orf62-232ENST00000584024 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
C17orf62-232ENST00000584024 CEP162Q5TB80 1403 aa25.59■■□□□ 1.69
C17orf62-232ENST00000584024 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.55■■□□□ 1.68
C17orf62-232ENST00000584024 KIF27Q86VH2 1401 aa25.51■■□□□ 1.67
C17orf62-232ENST00000584024 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.48■■□□□ 1.67
C17orf62-232ENST00000584024 NESP48681 1621 aa25.44■■□□□ 1.66
C17orf62-232ENST00000584024 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.44■■□□□ 1.66
C17orf62-232ENST00000584024 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.41■■□□□ 1.66
C17orf62-232ENST00000584024 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf62-232ENST00000584024 PRXQ9BXM0 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
C17orf62-232ENST00000584024 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.37■■□□□ 1.65
C17orf62-232ENST00000584024 CUX2O14529 1486 aa25.33■■□□□ 1.65
C17orf62-232ENST00000584024 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.33■■□□□ 1.65
C17orf62-232ENST00000584024 CLIP1P30622 1438 aa25.32■■□□□ 1.64
C17orf62-232ENST00000584024 TOPBP1Q92547 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
C17orf62-232ENST00000584024 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.29■■□□□ 1.64
C17orf62-232ENST00000584024 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
C17orf62-232ENST00000584024 IGF1RP08069 1367 aa25.21■■□□□ 1.63
C17orf62-232ENST00000584024 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
C17orf62-232ENST00000584024 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
C17orf62-232ENST00000584024 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.17■■□□□ 1.62
C17orf62-232ENST00000584024 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.15■■□□□ 1.62
C17orf62-232ENST00000584024 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.14■■□□□ 1.61
C17orf62-232ENST00000584024 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.12■■□□□ 1.61
C17orf62-232ENST00000584024 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.1■■□□□ 1.61
C17orf62-232ENST00000584024 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
C17orf62-232ENST00000584024 APLP2Q06481 763 aa25.01■■□□□ 1.59
C17orf62-232ENST00000584024 WDR97A6NE52 1622 aa25■■□□□ 1.59
C17orf62-232ENST00000584024 ARAP1Q96P48 1450 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf62-232ENST00000584024 CUL7Q14999 1698 aa24.97■■□□□ 1.59
C17orf62-232ENST00000584024 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
C17orf62-232ENST00000584024 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.94■■□□□ 1.58
C17orf62-232ENST00000584024 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.91■■□□□ 1.58
C17orf62-232ENST00000584024 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.9■■□□□ 1.58
C17orf62-232ENST00000584024 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.89■■□□□ 1.57
C17orf62-232ENST00000584024 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
C17orf62-232ENST00000584024 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
C17orf62-232ENST00000584024 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
C17orf62-232ENST00000584024 WDR62O43379 1518 aa24.77■■□□□ 1.56
C17orf62-232ENST00000584024 ERCC6Q03468 1493 aa24.74■■□□□ 1.55
C17orf62-232ENST00000584024 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.72■■□□□ 1.55
C17orf62-232ENST00000584024 IFT140Q96RY7 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
C17orf62-232ENST00000584024 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.7■■□□□ 1.54
C17orf62-232ENST00000584024 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms