Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMCO3A2RU48 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms