Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PFDN5Q99471 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PFDN5Q99471 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms