Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXT1Q16394 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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EXT1Q16394 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXT1Q16394 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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