Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRMT12Q53H54 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRMT12Q53H54 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms