Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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