Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LAD1O00515 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LAD1O00515 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAD1O00515 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAD1O00515 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAD1O00515 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms