Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms