Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RRN3P1Q2M238 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RRN3P1Q2M238 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RRN3P1Q2M238 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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