Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DPM3Q9P2X0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DPM3Q9P2X0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms