Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFDN5Q99471 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms