Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
WDR88Q6ZMY6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR88Q6ZMY6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms