Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHKBQ9Y259 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHKBQ9Y259 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHKBQ9Y259 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHKBQ9Y259 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHKBQ9Y259 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHKBQ9Y259 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms