Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SMC3Q9UQE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
SMC3Q9UQE7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SMC3Q9UQE7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SMC3Q9UQE7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMC3Q9UQE7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMC3Q9UQE7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms