Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHTF1Q9UMS5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PHTF1Q9UMS5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHTF1Q9UMS5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHTF1Q9UMS5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHTF1Q9UMS5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHTF1Q9UMS5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHTF1Q9UMS5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms