Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO1Q9UM00 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO1Q9UM00 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMCO1Q9UM00 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMCO1Q9UM00 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms