Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP17Q9ULZ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP17Q9ULZ9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MMP17Q9ULZ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MMP17Q9ULZ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MMP17Q9ULZ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MMP17Q9ULZ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MMP17Q9ULZ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms