Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNH3Q9ULD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNH3Q9ULD8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCNH3Q9ULD8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNH3Q9ULD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNH3Q9ULD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNH3Q9ULD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms