Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC13A4Q9UKG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A4Q9UKG4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC13A4Q9UKG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A4Q9UKG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC13A4Q9UKG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms