Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA1Q9UIW2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PLXNA1Q9UIW2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PLXNA1Q9UIW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PLXNA1Q9UIW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLXNA1Q9UIW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PLXNA1Q9UIW2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms