Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL3Q9UH77 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL3Q9UH77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL3Q9UH77 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL3Q9UH77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL3Q9UH77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms