Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPSF2Q9P2I0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPSF2Q9P2I0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CPSF2Q9P2I0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPSF2Q9P2I0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CPSF2Q9P2I0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPSF2Q9P2I0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms