Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NECAP2Q9NVZ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NECAP2Q9NVZ3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NECAP2Q9NVZ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms