Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPOQ9NVS9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPOQ9NVS9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNPOQ9NVS9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPOQ9NVS9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPOQ9NVS9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms