Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED17Q9NVC6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED17Q9NVC6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED17Q9NVC6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED17Q9NVC6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED17Q9NVC6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED17Q9NVC6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms