Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4BQ9NPR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4BQ9NPR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4BQ9NPR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4BQ9NPR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms