Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNB1IP1Q9NPC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNB1IP1Q9NPC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNB1IP1Q9NPC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms