Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XAB2Q9HCS7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XAB2Q9HCS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
XAB2Q9HCS7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
XAB2Q9HCS7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms