Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNRC6CQ9HCJ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNRC6CQ9HCJ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNRC6CQ9HCJ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TNRC6CQ9HCJ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TNRC6CQ9HCJ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TNRC6CQ9HCJ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TNRC6CQ9HCJ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TNRC6CQ9HCJ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TNRC6CQ9HCJ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms