Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPL44Q9H9J2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPL44Q9H9J2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPL44Q9H9J2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MRPL44Q9H9J2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MRPL44Q9H9J2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MRPL44Q9H9J2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MRPL44Q9H9J2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MRPL44Q9H9J2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MRPL44Q9H9J2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms