Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUBCNLQ9H714 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RUBCNLQ9H714 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RUBCNLQ9H714 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUBCNLQ9H714 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUBCNLQ9H714 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms