Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
YTHDC2Q9H6S0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
YTHDC2Q9H6S0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
YTHDC2Q9H6S0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
YTHDC2Q9H6S0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
YTHDC2Q9H6S0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
YTHDC2Q9H6S0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
YTHDC2Q9H6S0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
YTHDC2Q9H6S0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
YTHDC2Q9H6S0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
YTHDC2Q9H6S0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
YTHDC2Q9H6S0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
YTHDC2Q9H6S0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
YTHDC2Q9H6S0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
YTHDC2Q9H6S0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
YTHDC2Q9H6S0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
YTHDC2Q9H6S0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
YTHDC2Q9H6S0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms