Protein–RNA interactions for Protein: Q9H426

RIMS4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS4Q9H426 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIMS4Q9H426 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS4Q9H426 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS4Q9H426 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS4Q9H426 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms